1993年张以文接任主编。将该刊学术研究定位于：“以船山研究为核心，湖湘文化研究为主体，兼及中国传统文化研究”。为了适应新的形势发展和满足读者文化需求，逐年改进调整内容、栏目及版式，改变了以往研究内容单一、局限地域文化的状态，使研究领域和读者面更加广泛。1997年将原32开本改为16开本，2000年改为季刊，2001年改版大16开印刷，使刊物形象更为大气。
　　

　　2010年底楚玲接任主编。2011年开始推行双向匿名审稿制度和“三审”、“四校”制，并外聘专业人员严把质量关。建立专家库，增加约稿并减少发文篇数，不断提高优质稿比例。2012年设计既古朴厚重又典雅清新的封面，更新内芯版式，印刷质量有新的提升。2013年加强栏目建设和专题组约稿，在船山研究栏目和湖湘文化栏目推出系列专题专栏，产生了较好的学术影响。2012年和2013年刊物有4篇文章分别被《新华文摘》、《中国社科文摘》转摘，《人大复印资料》等刊物的转载率、转摘率、引用率较大提升。
　　

　　2014年周发源兼任主编，聘请王泽应为执行主编，增加了著名学者唐凯麟先生为编委会顾问，新增了学术委员会。与此同时，刊物调整了版式，改进了封面，使之更加美观，既符合百年老刊的风格，又给人耳目一新的感觉。刊物还对栏目进行了调整，每一期新增了卷首语。刊社人员在主编、执行主编、分管会领导带领下，在省内外深入开展调研，学习借鉴期刊界好的方法和经验，走访名家学者，加大了组、约稿的力度，使优质稿件比例大大提高，学术界给予了积极的肯定。2014年开始，《船山学刊》所刊文章被《新华文摘》、《中国社科文摘》、《人大复印资料》等重要文摘机构的转载率、摘登率大幅提升。根据国内外形势发展的需要，经申请并得到省新闻出版部门的批准，2015年1月第一期起，《船山学刊》由季刊改为双月刊出版发行。